Le village est situé à l'extrême nord-ouest de la Seine et Marne, en bordure de l'Oise et du Val d'Oise. Il est distant de 9 kilomètres de Dammartin en Goële (chef-lieu de canton) et de 29 kilomètres de Meaux (chef-lieu d'arrondissement).
A proximité immédiate de l'autoroute A1, Moussy Le Neuf se trouve à environ 20 mn de Paris et est proche également de l'Aéroport Roissy-Charles de Gaulle (en dehors des zones de bruit) et du Parc des Expositions de Villepinte Paris Nord II.
Le ru de la Biberonne prend sa source sur ce territoire, au bas de la colline de Montmélian (lieu-dit du Marais). Après avoir dirigé son cours vers Moussy le Vieux, il va se jeter dans la Beuvronne qui alimente la Marne.

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| vue aérienne de Moussy Le Neuf |